近年来，云南省迪庆藏族自治州藏医院突出藏医药特色，发挥藏医优势，建成集医疗、保健、教学、藏药生产于一体的综合性二级甲等民族医医院，为促进迪庆藏医药事业健康发展奠定了坚实基础。
迪庆藏医药资源丰富，因其临床疗效确切、预防保健作用独特、治疗方法灵活、费用低廉，深受广大患者青睐，是迪庆州重要的医疗资源，也是迪庆州医疗卫生事业一大特色和优势。迪庆州藏医院是云南省唯一一家专门从事藏医药学研究、藏药生产和藏医诊疗服务的民族医医院，藏药生产是该院的一项重要工作。1989 年，该院设立了藏医院藏药中心制剂室，致力于开发迪庆丰富的藏药材资源，改变了迪庆藏药靠外供应的被动局面。30多年来，该院制剂室先后研制生产藏成药140多个品种，其中七十味珍珠丸、珍珠开窍丸、芒觉、凯索美确（香格里拉肾宝）、日轮补肾丸、桑培通络丸、石榴温胃丸等深受广大患者的信赖。制剂室拥有以“佐太”为主的16个品种特殊原料的加工技术，基本做到了各种特殊原料自行研制生产，降低了用药成本。
在临床服务中，该院始终坚持“突出藏医药特色，发挥藏医优势，一切为了人民健康”的办院宗旨，积极吸收现代医学先进的诊断技术及治疗手段，结合藏医药内服外治的优势，提高专病专治水平，更好地满足人民群众多样化的就医需求。同时坚持发挥藏医特色，不断提高藏医药服务能力。开展尿诊、脉诊、霍尔美、药浴等73种藏医特色疗法，主要诊治心脑血管疾病、消化系统疾病、呼吸系统疾病、肝胆疾病、骨伤、肛肠疾病、脊柱骨关节病、风湿杂症等。该院芒觉丸、罗金丸、炊汤丸、防瘟九黑丸等藏药制剂在迪庆州预防及治疗新冠病毒感染中发挥了重要作用。
截至目前，该院制剂室生产的拥有院内制剂文号的 116 种藏药全部列入云南省医保报销目录支付，23项藏医医疗项目纳入云南省医保报销目录并按甲类项目支付。这一惠民政策切实有效减轻了老百姓的看病负担，真正把迪庆州藏医药服务的优势落到了实处，提升了迪庆州以及周边毗邻涉藏州、县参保群众的幸福感和获得感。
此外，该院积极保护和弘扬优秀民族医学文化遗产，在省、州药监部门及卫健委的指导支持下，搜集了部分珍贵的藏医药专著，编写了《藏医精要》《迪庆藏药》《云南藏医药》《迪庆藏药图鉴》等4部藏医药专著，推动形成迪庆特色的藏医药专著体系。2010年，以迪庆州藏医院为代表的“迪庆藏医药骨伤疗法”被列入国家非物质文化遗产保护名录。